Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPIRE1Q08AE8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPIRE1Q08AE8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms