Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBL2Q08999 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBL2Q08999 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RBL2Q08999 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RBL2Q08999 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RBL2Q08999 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RBL2Q08999 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RBL2Q08999 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RBL2Q08999 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBL2Q08999 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBL2Q08999 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 288.4 ms