Protein–RNA interactions for Protein: Q08639

Tfdp1, Transcription factor Dp-1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp1Q08639 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tfdp1Q08639 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfdp1Q08639 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms