Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGM3Q08188 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGM3Q08188 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGM3Q08188 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms