Protein–RNA interactions for Protein: Q08174

PCDH1, Protocadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH1Q08174 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH1Q08174 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms