Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPARAQ07869 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARAQ07869 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARAQ07869 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARAQ07869 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARAQ07869 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARAQ07869 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARAQ07869 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARAQ07869 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms