Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col9a2Q07643 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col9a2Q07643 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col9a2Q07643 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms