Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prrx2Q06348 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms