Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A2Q05940 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC18A2Q05940 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A2Q05940 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms