Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddr1Q03146 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddr1Q03146 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms