Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctnnb1Q02248 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnnb1Q02248 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnnb1Q02248 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnb1Q02248 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms