Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRKCEQ02156 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKCEQ02156 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms