Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ascl1Q02067 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ascl1Q02067 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms