Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POU5F1Q01860 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POU5F1Q01860 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms