Protein–RNA interactions for Protein: Q01730

Rsu1, Ras suppressor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsu1Q01730 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rsu1Q01730 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rsu1Q01730 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsu1Q01730 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms