Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF2Q01130 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF2Q01130 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRSF2Q01130 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms