Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE1BQ01064 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms