Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoa1Q00623 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms