Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSF1Q00613 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSF1Q00613 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSF1Q00613 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms