Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rbbp6P97868 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rbbp6P97868 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rbbp6P97868 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rbbp6P97868 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rbbp6P97868 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rbbp6P97868 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rbbp6P97868 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rbbp6P97868 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rbbp6P97868 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rbbp6P97868 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rbbp6P97868 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rbbp6P97868 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rbbp6P97868 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rbbp6P97868 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbbp6P97868 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbbp6P97868 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbbp6P97868 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbbp6P97868 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbbp6P97868 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms