Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Psme1P97371 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Psme1P97371 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Psme1P97371 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Psme1P97371 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Psme1P97371 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Psme1P97371 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Psme1P97371 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Psme1P97371 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Psme1P97371 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Psme1P97371 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Psme1P97371 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Psme1P97371 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Psme1P97371 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Psme1P97371 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Psme1P97371 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Psme1P97371 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Psme1P97371 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Psme1P97371 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Psme1P97371 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Psme1P97371 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Psme1P97371 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Psme1P97371 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Psme1P97371 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Psme1P97371 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Psme1P97371 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Psme1P97371 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Psme1P97371 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Psme1P97371 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Psme1P97371 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Psme1P97371 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Psme1P97371 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Psme1P97371 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Psme1P97371 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Psme1P97371 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms