Protein–RNA interactions for Protein: P97361

Bpifa1, BPI fold-containing family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa1P97361 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bpifa1P97361 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bpifa1P97361 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bpifa1P97361 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bpifa1P97361 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bpifa1P97361 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bpifa1P97361 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms