Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CiitaP79621 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CiitaP79621 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CiitaP79621 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CiitaP79621 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CiitaP79621 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CiitaP79621 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CiitaP79621 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CiitaP79621 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CiitaP79621 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CiitaP79621 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CiitaP79621 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CiitaP79621 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CiitaP79621 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CiitaP79621 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms