Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ELF3P78545 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELF3P78545 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELF3P78545 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELF3P78545 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELF3P78545 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ELF3P78545 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELF3P78545 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELF3P78545 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELF3P78545 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELF3P78545 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELF3P78545 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELF3P78545 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ELF3P78545 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELF3P78545 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELF3P78545 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELF3P78545 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELF3P78545 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ELF3P78545 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELF3P78545 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ELF3P78545 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELF3P78545 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELF3P78545 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELF3P78545 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELF3P78545 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELF3P78545 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELF3P78545 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELF3P78545 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELF3P78545 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ELF3P78545 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELF3P78545 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELF3P78545 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELF3P78545 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELF3P78545 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELF3P78545 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELF3P78545 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELF3P78545 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELF3P78545 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELF3P78545 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELF3P78545 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELF3P78545 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ELF3P78545 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ELF3P78545 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ELF3P78545 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ELF3P78545 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ELF3P78545 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ELF3P78545 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ELF3P78545 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ELF3P78545 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ELF3P78545 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ELF3P78545 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELF3P78545 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELF3P78545 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELF3P78545 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELF3P78545 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELF3P78545 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELF3P78545 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELF3P78545 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELF3P78545 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELF3P78545 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELF3P78545 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELF3P78545 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELF3P78545 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELF3P78545 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELF3P78545 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELF3P78545 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELF3P78545 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ELF3P78545 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELF3P78545 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELF3P78545 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELF3P78545 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELF3P78545 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELF3P78545 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELF3P78545 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELF3P78545 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELF3P78545 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELF3P78545 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELF3P78545 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELF3P78545 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELF3P78545 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELF3P78545 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELF3P78545 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELF3P78545 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELF3P78545 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELF3P78545 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELF3P78545 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELF3P78545 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELF3P78545 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELF3P78545 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELF3P78545 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELF3P78545 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELF3P78545 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELF3P78545 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELF3P78545 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELF3P78545 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELF3P78545 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELF3P78545 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELF3P78545 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELF3P78545 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELF3P78545 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms