Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHC1P78364 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHC1P78364 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHC1P78364 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHC1P78364 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHC1P78364 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHC1P78364 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHC1P78364 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHC1P78364 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHC1P78364 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHC1P78364 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHC1P78364 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHC1P78364 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHC1P78364 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHC1P78364 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHC1P78364 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHC1P78364 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PHC1P78364 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHC1P78364 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHC1P78364 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHC1P78364 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHC1P78364 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHC1P78364 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHC1P78364 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHC1P78364 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHC1P78364 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHC1P78364 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHC1P78364 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHC1P78364 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHC1P78364 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHC1P78364 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PHC1P78364 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHC1P78364 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHC1P78364 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHC1P78364 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHC1P78364 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHC1P78364 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC1P78364 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC1P78364 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC1P78364 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC1P78364 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC1P78364 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC1P78364 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC1P78364 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC1P78364 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC1P78364 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC1P78364 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHC1P78364 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHC1P78364 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHC1P78364 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHC1P78364 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHC1P78364 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHC1P78364 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHC1P78364 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHC1P78364 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHC1P78364 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHC1P78364 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHC1P78364 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHC1P78364 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHC1P78364 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHC1P78364 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHC1P78364 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHC1P78364 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHC1P78364 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHC1P78364 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHC1P78364 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHC1P78364 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHC1P78364 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHC1P78364 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHC1P78364 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHC1P78364 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHC1P78364 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHC1P78364 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHC1P78364 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHC1P78364 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHC1P78364 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHC1P78364 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHC1P78364 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHC1P78364 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHC1P78364 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHC1P78364 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHC1P78364 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PHC1P78364 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHC1P78364 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHC1P78364 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHC1P78364 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHC1P78364 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHC1P78364 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHC1P78364 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHC1P78364 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHC1P78364 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHC1P78364 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHC1P78364 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHC1P78364 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHC1P78364 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHC1P78364 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHC1P78364 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHC1P78364 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHC1P78364 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHC1P78364 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms