Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema3eP70275 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema3eP70275 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema3eP70275 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema3eP70275 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema3eP70275 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema3eP70275 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema3eP70275 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema3eP70275 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema3eP70275 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema3eP70275 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema3eP70275 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms