Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2IP63279 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2IP63279 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2IP63279 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms