Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acta2P62737 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acta2P62737 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acta2P62737 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acta2P62737 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acta2P62737 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acta2P62737 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acta2P62737 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acta2P62737 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acta2P62737 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acta2P62737 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms