Protein–RNA interactions for Protein: P62269

RPS18, 40S ribosomal protein S18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS18P62269 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS18P62269 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS18P62269 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS18P62269 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS18P62269 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS18P62269 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS18P62269 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS18P62269 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS18P62269 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS18P62269 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS18P62269 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS18P62269 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS18P62269 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS18P62269 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS18P62269 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS18P62269 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS18P62269 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS18P62269 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS18P62269 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS18P62269 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS18P62269 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS18P62269 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS18P62269 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS18P62269 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS18P62269 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS18P62269 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS18P62269 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS18P62269 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS18P62269 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS18P62269 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS18P62269 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS18P62269 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS18P62269 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS18P62269 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS18P62269 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS18P62269 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS18P62269 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS18P62269 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS18P62269 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS18P62269 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS18P62269 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS18P62269 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS18P62269 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS18P62269 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS18P62269 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS18P62269 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS18P62269 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS18P62269 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS18P62269 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS18P62269 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS18P62269 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS18P62269 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS18P62269 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS18P62269 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS18P62269 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPS18P62269 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS18P62269 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS18P62269 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS18P62269 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS18P62269 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS18P62269 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS18P62269 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS18P62269 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS18P62269 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS18P62269 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS18P62269 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS18P62269 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS18P62269 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS18P62269 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS18P62269 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS18P62269 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS18P62269 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS18P62269 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS18P62269 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS18P62269 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS18P62269 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS18P62269 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS18P62269 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS18P62269 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS18P62269 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS18P62269 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS18P62269 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS18P62269 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS18P62269 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS18P62269 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS18P62269 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS18P62269 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS18P62269 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS18P62269 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS18P62269 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS18P62269 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS18P62269 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS18P62269 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS18P62269 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS18P62269 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS18P62269 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS18P62269 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS18P62269 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS18P62269 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS18P62269 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms