Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copz1P61924 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Copz1P61924 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copz1P61924 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Copz1P61924 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copz1P61924 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copz1P61924 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copz1P61924 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copz1P61924 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copz1P61924 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copz1P61924 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copz1P61924 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copz1P61924 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copz1P61924 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copz1P61924 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copz1P61924 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copz1P61924 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copz1P61924 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copz1P61924 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copz1P61924 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copz1P61924 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copz1P61924 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copz1P61924 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copz1P61924 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copz1P61924 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Copz1P61924 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Copz1P61924 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Copz1P61924 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Copz1P61924 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.3 ms