Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P58686 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P58686 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P58686 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P58686 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P58686 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P58686 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P58686 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P58686 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P58686 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P58686 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P58686 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P58686 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P58686 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P58686 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
P58686 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P58686 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P58686 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P58686 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P58686 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P58686 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P58686 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P58686 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P58686 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P58686 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P58686 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P58686 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P58686 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P58686 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P58686 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P58686 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P58686 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P58686 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P58686 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P58686 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P58686 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P58686 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P58686 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P58686 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P58686 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P58686 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P58686 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P58686 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P58686 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P58686 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P58686 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P58686 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P58686 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P58686 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P58686 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P58686 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P58686 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P58686 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P58686 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P58686 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P58686 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P58686 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P58686 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P58686 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P58686 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P58686 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P58686 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P58686 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P58686 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P58686 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P58686 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P58686 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P58686 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P58686 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P58686 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P58686 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P58686 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P58686 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P58686 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P58686 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P58686 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P58686 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P58686 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P58686 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P58686 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P58686 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P58686 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P58686 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P58686 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P58686 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P58686 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P58686 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P58686 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P58686 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P58686 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P58686 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P58686 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P58686 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P58686 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P58686 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P58686 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P58686 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P58686 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P58686 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P58686 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms