Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Samsn1P57725 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Samsn1P57725 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Samsn1P57725 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.6 ms