Protein–RNA interactions for Protein: P57088

TMEM33, Transmembrane protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM33P57088 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM33P57088 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM33P57088 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM33P57088 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM33P57088 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM33P57088 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM33P57088 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM33P57088 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM33P57088 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM33P57088 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM33P57088 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM33P57088 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM33P57088 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM33P57088 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM33P57088 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM33P57088 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM33P57088 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM33P57088 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM33P57088 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM33P57088 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM33P57088 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM33P57088 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms