Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Exosc10P56960 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Exosc10P56960 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Exosc10P56960 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Exosc10P56960 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Exosc10P56960 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Exosc10P56960 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms