Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN15P56746 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN15P56746 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN15P56746 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN15P56746 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN15P56746 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN15P56746 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN15P56746 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN15P56746 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLDN15P56746 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN15P56746 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN15P56746 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN15P56746 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN15P56746 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN15P56746 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLDN15P56746 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN15P56746 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN15P56746 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN15P56746 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN15P56746 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLDN15P56746 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN15P56746 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN15P56746 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN15P56746 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN15P56746 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN15P56746 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN15P56746 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN15P56746 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN15P56746 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN15P56746 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN15P56746 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN15P56746 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN15P56746 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN15P56746 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN15P56746 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN15P56746 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN15P56746 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN15P56746 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN15P56746 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLDN15P56746 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN15P56746 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN15P56746 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLDN15P56746 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLDN15P56746 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN15P56746 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN15P56746 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN15P56746 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN15P56746 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN15P56746 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN15P56746 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN15P56746 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN15P56746 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN15P56746 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN15P56746 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN15P56746 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN15P56746 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms