Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rp1P56716 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rp1P56716 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rp1P56716 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rp1P56716 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rp1P56716 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rp1P56716 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rp1P56716 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rp1P56716 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rp1P56716 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rp1P56716 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rp1P56716 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rp1P56716 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rp1P56716 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rp1P56716 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rp1P56716 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rp1P56716 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1P56716 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1P56716 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1P56716 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rp1P56716 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rp1P56716 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.6 ms