Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc12a1P55014 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc12a1P55014 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc12a1P55014 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc12a1P55014 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc12a1P55014 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc12a1P55014 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc12a1P55014 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc12a1P55014 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc12a1P55014 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc12a1P55014 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc12a1P55014 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc12a1P55014 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc12a1P55014 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc12a1P55014 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc12a1P55014 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc12a1P55014 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc12a1P55014 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc12a1P55014 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms