Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMP3P54852 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMP3P54852 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMP3P54852 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMP3P54852 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMP3P54852 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMP3P54852 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMP3P54852 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMP3P54852 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMP3P54852 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EMP3P54852 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMP3P54852 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMP3P54852 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMP3P54852 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMP3P54852 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMP3P54852 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMP3P54852 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMP3P54852 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMP3P54852 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMP3P54852 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EMP3P54852 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMP3P54852 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMP3P54852 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMP3P54852 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMP3P54852 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMP3P54852 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMP3P54852 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMP3P54852 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMP3P54852 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMP3P54852 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMP3P54852 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMP3P54852 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMP3P54852 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMP3P54852 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMP3P54852 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMP3P54852 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMP3P54852 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMP3P54852 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMP3P54852 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMP3P54852 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMP3P54852 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMP3P54852 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMP3P54852 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMP3P54852 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMP3P54852 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMP3P54852 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMP3P54852 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMP3P54852 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMP3P54852 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMP3P54852 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMP3P54852 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMP3P54852 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMP3P54852 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMP3P54852 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMP3P54852 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMP3P54852 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMP3P54852 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMP3P54852 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMP3P54852 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMP3P54852 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMP3P54852 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMP3P54852 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMP3P54852 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMP3P54852 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMP3P54852 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMP3P54852 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMP3P54852 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMP3P54852 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMP3P54852 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMP3P54852 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMP3P54852 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMP3P54852 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMP3P54852 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMP3P54852 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMP3P54852 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EMP3P54852 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMP3P54852 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMP3P54852 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMP3P54852 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMP3P54852 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMP3P54852 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMP3P54852 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMP3P54852 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMP3P54852 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EMP3P54852 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMP3P54852 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMP3P54852 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EMP3P54852 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMP3P54852 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EMP3P54852 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMP3P54852 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMP3P54852 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMP3P54852 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMP3P54852 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMP3P54852 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMP3P54852 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMP3P54852 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EMP3P54852 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EMP3P54852 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EMP3P54852 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms