Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN5P54829 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN5P54829 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms