Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RabggtbP53612 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RabggtbP53612 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RabggtbP53612 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RabggtbP53612 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms