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Protein–RNA interactions for Protein: P53047
RTA1, Protein RTA1, yeast
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
RTA1
P53047
EMW1
YNL313C
2715 nt
6.54
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
IMG1
YCR046C
510 nt
6.54
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
HMS2
YJR147W
1077 nt
6.54
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
YLR312C
YLR312C
1197 nt
6.54
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
YBL029W
YBL029W
1131 nt
6.54
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
ECM31
YBR176W
939 nt
6.54
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
YGR054W
YGR054W
1929 nt
6.54
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
ERG8
YMR220W
1356 nt
6.54
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
YLH47
YPR125W
1365 nt
6.54
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
YMR155W
YMR155W
1644 nt
6.54
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
HXT7
YDR342C
1713 nt
6.53
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
HXT6
YDR343C
1713 nt
6.53
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
HXT3
YDR345C
1704 nt
6.53
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
HST4
YDR191W
1113 nt
6.53
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
NVJ1
YHR195W
966 nt
6.53
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
PSR1
YLL010C
1284 nt
6.53
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
CKS1
YBR135W
453 nt
6.53
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
AME1
YBR211C
975 nt
6.53
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
CHL4
YDR254W
1377 nt
6.53
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
CRP1
YHR146W
1398 nt
6.53
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
ACO1
YLR304C
2337 nt
6.53
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
MSS1
YMR023C
1581 nt
6.52
□□□□□ -1.36
RTA1
P53047
PHO3
YBR092C
1404 nt
6.52
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
ADE17
YMR120C
1779 nt
6.52
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
SKY1
YMR216C
2229 nt
6.52
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
YJL215C
YJL215C
360 nt
6.52
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
MEH1
YKR007W
555 nt
6.52
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
DOM34
YNL001W
1161 nt
6.52
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
YPL168W
YPL168W
1293 nt
6.52
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
IVY1
YDR229W
1362 nt
6.52
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
GPD2
YOL059W
1323 nt
6.51
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
PYK2
YOR347C
1521 nt
6.51
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
VPS36
YLR417W
1701 nt
6.51
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
CTR2
YHR175W
570 nt
6.51
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
ERP2
YAL007C
648 nt
6.51
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
YKR045C
YKR045C
552 nt
6.51
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
YLR036C
YLR036C
612 nt
6.51
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
YLR311C
YLR311C
348 nt
6.51
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
YOR111W
YOR111W
699 nt
6.51
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
VPS28
YPL065W
729 nt
6.51
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
RIX7
YLL034C
2514 nt
6.51
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
DUO1
YGL061C
744 nt
6.5
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
YNG2
YHR090C
849 nt
6.5
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
TSR2
YLR435W
618 nt
6.5
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
YOR020W-A
YOR020W-A
273 nt
6.5
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
SUI3
YPL237W
858 nt
6.5
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
PXL1
YKR090W
2121 nt
6.5
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
DDC1
YPL194W
1839 nt
6.5
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
ATR1
YML116W
1629 nt
6.5
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
YHR095W
YHR095W
495 nt
6.49
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
DMA1
YHR115C
1251 nt
6.49
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
QCR8
YJL166W
285 nt
6.49
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
YMR135W-A
YMR135W-A
534 nt
6.49
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
GTO3
YMR251W
1101 nt
6.49
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
SSP2
YOR242C
1116 nt
6.49
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
HXT15
YDL245C
1704 nt
6.49
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
HXT16
YJR158W
1704 nt
6.49
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
ARG81
YML099C
2643 nt
6.49
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
CLN1
YMR199W
1641 nt
6.49
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
UGO1
YDR470C
1509 nt
6.49
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
UIP5
YKR044W
1332 nt
6.49
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
ERG26
YGL001C
1050 nt
6.48
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
YGL072C
YGL072C
360 nt
6.48
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
YLF2
YHL014C
1218 nt
6.48
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
LCB3
YJL134W
1230 nt
6.48
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
YLL059C
YLL059C
507 nt
6.48
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
TOM40
YMR203W
1164 nt
6.48
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
YNL143C
YNL143C
393 nt
6.48
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
PTC4
YBR125C
1182 nt
6.48
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
MAD3
YJL013C
1548 nt
6.48
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
ZWF1
YNL241C
1518 nt
6.48
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
PTC3
YBL056W
1407 nt
6.48
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
FAA4
YMR246W
2085 nt
6.48
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
NMT1
YLR195C
1368 nt
6.47
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
DAL4
YIR028W
1908 nt
6.47
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
RMD1
YDL001W
1293 nt
6.47
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
SNM1
YDR478W
597 nt
6.47
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
FPR2
YDR519W
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6.47
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
MOB2
YFL034C-B
864 nt
6.47
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
SPO74
YGL170C
1242 nt
6.47
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
PCL1
YNL289W
840 nt
6.47
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
KTR1
YOR099W
1182 nt
6.47
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
PRP2
YNR011C
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6.47
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
SMF3
YLR034C
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6.47
□□□□□ -1.37
RTA1
P53047
VMS1
YDR049W
1899 nt
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□□□□□ -1.38
RTA1
P53047
SCL1
YGL011C
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□□□□□ -1.38
RTA1
P53047
POP5
YAL033W
522 nt
6.46
□□□□□ -1.38
RTA1
P53047
JNM1
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RTA1
P53047
IES2
YNL215W
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RTA1
P53047
ORC5
YNL261W
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□□□□□ -1.38
RTA1
P53047
NUP1
YOR098C
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□□□□□ -1.38
RTA1
P53047
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YOR286W
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□□□□□ -1.38
RTA1
P53047
ISA2
YPR067W
558 nt
6.46
□□□□□ -1.38
RTA1
P53047
YJR124C
YJR124C
1347 nt
6.46
□□□□□ -1.38
RTA1
P53047
IPI3
YNL182C
1668 nt
6.45
□□□□□ -1.38
RTA1
P53047
MRE11
YMR224C
2079 nt
6.45
□□□□□ -1.38
RTA1
P53047
INO2
YDR123C
915 nt
6.45
□□□□□ -1.38
RTA1
P53047
VPS61
YDR136C
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6.45
□□□□□ -1.38
RTA1
P53047
AIM20
YIL158W
615 nt
6.45
□□□□□ -1.38
RTA1
P53047
YKL031W
YKL031W
414 nt
6.45
□□□□□ -1.38
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