Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dbx1P52950 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dbx1P52950 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dbx1P52950 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms