Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPT1P50897 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPT1P50897 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPT1P50897 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPT1P50897 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPT1P50897 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPT1P50897 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPT1P50897 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPT1P50897 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPT1P50897 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPT1P50897 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPT1P50897 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPT1P50897 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPT1P50897 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPT1P50897 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPT1P50897 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPT1P50897 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPT1P50897 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPT1P50897 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPT1P50897 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPT1P50897 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPT1P50897 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPT1P50897 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PPT1P50897 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPT1P50897 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPT1P50897 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPT1P50897 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPT1P50897 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPT1P50897 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPT1P50897 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PPT1P50897 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPT1P50897 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PPT1P50897 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPT1P50897 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPT1P50897 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPT1P50897 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPT1P50897 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPT1P50897 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPT1P50897 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPT1P50897 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPT1P50897 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPT1P50897 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPT1P50897 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPT1P50897 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPT1P50897 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPT1P50897 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPT1P50897 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPT1P50897 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPT1P50897 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPT1P50897 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPT1P50897 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPT1P50897 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPT1P50897 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPT1P50897 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPT1P50897 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPT1P50897 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPT1P50897 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPT1P50897 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPT1P50897 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPT1P50897 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPT1P50897 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PPT1P50897 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPT1P50897 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPT1P50897 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPT1P50897 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPT1P50897 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPT1P50897 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPT1P50897 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPT1P50897 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPT1P50897 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PPT1P50897 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPT1P50897 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPT1P50897 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPT1P50897 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPT1P50897 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPT1P50897 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPT1P50897 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPT1P50897 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPT1P50897 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPT1P50897 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPT1P50897 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPT1P50897 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPT1P50897 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPT1P50897 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPT1P50897 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPT1P50897 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPT1P50897 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPT1P50897 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPT1P50897 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPT1P50897 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPT1P50897 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPT1P50897 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PPT1P50897 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPT1P50897 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPT1P50897 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PPT1P50897 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPT1P50897 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPT1P50897 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPT1P50897 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PPT1P50897 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms