Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hcls1P49710 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hcls1P49710 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hcls1P49710 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hcls1P49710 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hcls1P49710 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hcls1P49710 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hcls1P49710 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hcls1P49710 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hcls1P49710 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hcls1P49710 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hcls1P49710 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hcls1P49710 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hcls1P49710 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hcls1P49710 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hcls1P49710 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Hcls1P49710 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms