Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brca1P48754 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brca1P48754 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brca1P48754 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brca1P48754 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brca1P48754 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brca1P48754 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brca1P48754 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brca1P48754 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brca1P48754 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brca1P48754 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brca1P48754 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Brca1P48754 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brca1P48754 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brca1P48754 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brca1P48754 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brca1P48754 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brca1P48754 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brca1P48754 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brca1P48754 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Brca1P48754 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brca1P48754 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms