Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edn3P48299 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edn3P48299 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edn3P48299 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edn3P48299 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edn3P48299 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edn3P48299 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Edn3P48299 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edn3P48299 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edn3P48299 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edn3P48299 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edn3P48299 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edn3P48299 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edn3P48299 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Edn3P48299 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edn3P48299 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edn3P48299 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edn3P48299 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edn3P48299 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edn3P48299 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edn3P48299 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edn3P48299 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edn3P48299 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Edn3P48299 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edn3P48299 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edn3P48299 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edn3P48299 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edn3P48299 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms