Protein–RNA interactions for Protein: P47879

Igfbp4, Insulin-like growth factor-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp4P47879 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Igfbp4P47879 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Igfbp4P47879 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Igfbp4P47879 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Igfbp4P47879 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Igfbp4P47879 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Igfbp4P47879 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Igfbp4P47879 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Igfbp4P47879 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Igfbp4P47879 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Igfbp4P47879 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms