Protein–RNA interactions for Protein: P46718

Pdcd2, Programmed cell death protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd2P46718 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pdcd2P46718 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms