Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC1A2P43004 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC1A2P43004 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms