Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MTHFRP42898 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTHFRP42898 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms